Analisi del segnale EEG e ricostruzione delle sorgenti tramite il software Brainstorm

Finalità:

Il corso ha la finalità di fornire un'introduzione generale all'utilizzo del software Brainstorm per il pre-processing del segnale EEG, con maggiore attenzione agli aspetti teorici e pratici di ricostruzione di sorgente. I momenti pratici del corso verranno divisi in due, nella prima parte verrà affrontata la preparazione del segnale EEG per l'analisi di sorgente, la seconda parte invece sarà focalizzata sulla ricostruzione di sorgente approfondendo anche gli aspetti teorici di base. Sarà privilegiato un approccio molto pratico, con sessioni di analisi di veri dati EEG tramite il software Brainstorm. Brainstorm è un toolbox gratuito dal semplice utilizzo e che permette una grande interazione con i dati e con le figure. Questi elementi, insieme alla sua continua evoluzione e possibilità di interfaccia con altre toolbox, lo hanno reso uno degli strumenti più utilizzati al livello internazionale per l'analisi dei dati dell'attività neurale. A causa delle limitazioni alle lezioni frontali il corso verrà svolto online -in diretta- tramite la piattaforma Zoom. Si cercherà comunque di massimizzare lo spirito del corso, ovvero una massima interazione con il docente. È possibile utilizzare Brainstorm solo dopo aver scaricato Matlab. 

Software utilizzato:

Durante il corso utilizzeremo un tool-box gratuito chiamato Brainstorm. È possibile scaricarlo gratuitamente al seguente sito: https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/Introduction

Per scaricarlo, premere il tasto Download nella parte in alto a sinistra nella pagina indicata. Vi verrà chiesto di creare il vostro account. Create il vostro account e scaricate il pacchetto 'source+binary'. Fatelo se possibile prima dell'inizio del corso. L'istallazione del pacchetto sarà fatta insieme all'inizio del corso.

IMPORTANTE: È possibile utilizzare Brainstorm solo dopo aver scaricato Matlab. Data la lunghezza della procedura di download ed istallazione di Matlab, se ne richiede l'istallazione autonoma da parte dello studente sul suo pc personale, PRIMA DELL'INIZIO DEL CORSO. Questo ha lo scopo di evitare di perdere momenti didattici all'interno del corso. L'università mette a disposizione licenze gratuite di Matlab per gli studenti. La procedura di installazione è semplice e necessita solo della creazione di un account su Mathworks. Per creare il vostro account Mathworks e scaricare Matlab sul vostro computer, vi basta seguire le istruzioni al seguente sito: https://www.ict.unipd.it/servizi/servizi-utenti-istituzionali/contratti-...

Per eventuali problemi nell'installazione di Matlab é possibile contattare il docente anche prima dell'inizio del corso.

Programma del corso:

Lunedi 19- Installazione guidata di brainstorm su Matlab; Introduzione al software Brainstorm; Introduzione teorica alla ricostruzione di sorgente

Martedì 20- Introduzione alla creazione di un paradigma per lo studio di Potenziali evento relati (ERP) e le loro sorgenti; Inizio pre-processig del segnale (identificazione artefatti e filtri) con esercitazione tramite il software

Mercoledì 21- Pulizia del segnale tramite Indipendent Component Analysis (ICA) ed epocaggio del segnale tramite software. Introduzione alle opzioni di ricostruzione di sorgente del software.

Giovedì 22- Ricostruzione di sorgente tramite Brainstorm

Venerdì 23- Sessione Q&A; prova finale

 

Le lezioni cercheranno di rispettare sessioni da 1h e 45min intervallate da 2 pause di 15/20 min. 

 

 

Prerequisiti: Conoscenza di base del segnale EEG

Durata del corso: 20

Aule di svolgimento delle lezioni: Zoom sincrono

Numero massimo di partecipanti: 10 persone

Conduttore: Gian Marco Duma 

gianmarco.duma@unipd.it

 

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