Analisi del segnale EEG e ricostruzione delle sorgenti tramite il software brainstorm / EEG analysis and cortical source reconstruction via brainstorm toolbox

Finalità
Purpose

Il corso ha la finalità di fornire un'introduzione generale all'utilizzo del software Brainstorm per l'analisi del segnale EEG, con maggiore attenzione agli aspetti teorici e pratici di ricostruzione di sorgente. I momenti pratici del corso verranno divisi in due, nella prima parte verrà affrontata la preparazione del segnale EEG per l'analisi di sorgente, la seconda parte invece sarà focalizzata sulla ricostruzione di sorgente approfondendo anche gli aspetti teorici di base. Sarà privilegiato un approccio molto pratico, con sessioni di analisi di veri dati EEG tramite il software Brainstorm. Brainstorm è un toolbox gratuito dal semplice utilizzo e che permette una grande interazione con i dati e con le figure. Questi elementi, insieme alla sua continua evoluzione e possibilità di interfaccia con altre toolbox, lo hanno reso uno degli strumenti più utilizzati al livello internazionale per l'analisi dei dati dell'attività neurale.

The course aims to provide a general introduction to the use of Brainstorm software for EEG signal analysis, with greater attention to the theoretical and practical aspects of source reconstruction. The practical moments of the course will be divided into two parts, the first part will deal with the preparation of the EEG signal for source analysis, the second part will focus on the reconstruction of the source also deepening the basic theoretical aspects. A very practical approach will be preferred, with sessions of analysis of real EEG data using the software Brainstorm. Brainstorm is a free toolbox easy to use and that allows a great interaction with data and figures. These elements, together with its continuous evolution and possibility of interface with other toolboxes, have made it one of the most used tools at international level for the analysis of neural activity data.

Software utilizzato
Software used

Durante il corso utilizzeremo un tool-box gratuito chiamato Brainstorm. È possibile scaricarlo gratuitamente al seguente sito: https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/Introduction

Per scaricarlo, premere il tasto Download nella parte in alto a sinistra nella pagina indicata. Vi verrà chiesto di creare il vostro account. Create il vostro account e scaricate il pacchetto 'source+binary'. L'istallazione del pacchetto sarà fatta insieme all'inizio del corso.

IMPORTANTE: È possibile utilizzare Brainstorm solo dopo aver scaricato Matlab. L'università mette a disposizione licenze gratuite di Matlab per gli studenti. La procedura di installazione è semplice e necessita solo della creazione di un account su Mathworks. Per creare il vostro account Mathworks e scaricare Matlab sul vostro computer, vi basta seguire le istruzioni al seguente sito:  https://www.ict.unipd.it/servizi/servizi-utenti-istituzionali/contratti-...

During the course we will be using a free tool-box called Brainstorm. You can download it for free at the following site: https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/Introduction

To download it, press the Download button at the top left part of the indicated page. You will be asked to create your account. Create your account and download the 'source+binary' package. The installation of the package will be done together at the beginning of the course.

IMPORTANT: You can use Brainstorm only after downloading Matlab. The installation process is simple and only requires creating an account on Mathworks. To create your Mathworks account and download Matlab to your computer, simply follow the instructions at the following site: https://www.ict.unipd.it/servizi/servizi-utenti-istituzionali/contratti-software-e-licenze/matlab

Programma del corso

Lezione 1
- Installazione guidata di brainstorm su Matlab; Introduzione al software Brainstorm; Introduzione teorica alla ricostruzione di sorgente
Lezione 2
- Introduzione alla creazione di un paradigma per lo studio di Potenziali evento relati (ERP) e le loro sorgenti; Inizio pre-processig del segnale (identificazione artefatti e filtri) con esercitazione tramite il software
Lezione 3
- Pulizia del segnale tramite Indipendent Component Analysis (ICA) ed epocaggio del segnale tramite software. Introduzione alle opzioni di ricostruzione di sorgente del software e ricostruzione superficie corticale.
Lezione 4
- Ricostruzione di sorgente tramite Brainstorm
Lezione 5
- Sessione Q&A; prova finale

Course program

Lesson 1
 - Guided installation of Brainstorm on Matlab; Introduction to Brainstorm software; Theoretical introduction to source reconstruction
Lesson 2
- Introduction to the creation of a paradigm for the study of Event-Related Potentials (ERPs) and their sources; Starting signal pre-processing (artifact and filter identification) with practice using the software
Lesson 3
- Signal cleaning via Independent Component Analysis (ICA) and signal epocessing via software. Introduction to software source reconstruction options and cortical surface segmentation.
Lesson 4
 - Source reconstruction using Brainstorm
Lesson 5
- Q&A session; final test

 


Prerequisiti/Prerequisites: E’ preferibile (ma non necessario) avere una conoscenza base del segnale EEG/ It is preferable (but not necessary) to have a basic knowledge of the EEG signal

Durata del corso/Duration of the course: 20 ore/hours

Aule di svolgimento delle lezioni/Classrooms for lessons: 4M-via Venezia, 12

Possibilità di erogare il corso in inglese/Possibility of delivering the course in English: Si/Yes

Numero massimo partecipanti/Maximum number of participants:

Conduttore/Conductor: Gianmarco Duma

gianmarco.duma@unipd.it

 

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